一般病棟入院基本料7 対1、10 対1 を算定する病棟に90 日を超えて入院す る患者のうち厚生労働大臣が定める状態等にある患者（以下、特定除外患者。 表 1.1.1）は、特定入院基本料の算定対象から除かれるとともに、平均在院日 数の算定の対象にならない（表 1.1.3）。 これを特定除外制度という。

一般病棟入院基本料を算定する病棟（従前の7対1相当の急性期一般入院料1など）において、「90日を超えて入院する患者」については、▼当該一般病棟入院基本料を算定するが、平均在院日数の計算に加える▼平均在院日数の計算から除外するが、療養病棟入院基本料1を算定する―のいずれかを病院で選択する。

一般病棟（一般病棟入院基本料、特定機能病院入院基本料（一般病棟に限る。 ）又は専門病院入院基本料を算定する病棟を除く。 ）に入院した日から起算して ９０日 を超えて入院している患者であって、医科点数表第１章第２部第１節障害者施設等入院基本料の「注５」に規定する厚生労働大臣の定める状態等にあるもの